Das JC-Virus kann jedoch bei Menschen mit geschwächtem Immunsystem, wie z.B. bei Patienten mit MS, zu schweren Erkrankungen führen.
Eine solche Erkrankung ist die Progressive multifokale Leukenzephalopathie (PML), die das Gehirn betrifft und oft tödlich verlaufen kann.
Bei Patienten mit Multipler Sklerose (MS) kann das JC-Virus eine Rolle spielen, da es in Zusammenhang mit der Einnahme bestimmter MS-Medikamente, insbesondere mit Natalizumab und Ocrelizumab, ein erhöhtes Risiko für die Entwicklung von PML darstellt. Daher ist es wichtig, dass Patienten, die diese Medikamente erhalten, regelmäßig auf das Vorhandensein von JCV getestet werden, um das Risiko einer PML zu bewerten.